清代及其以前，马尾地区所属马尾、亭江、琅岐镇建制为乡以下的“里”。南宋淳熙年间，磕源(快安)、筋竹(今君竹)、石山则是里以下“图”，只闽安设镇，称为闽安镇(汛)。清代初，中岐(即马尾旧镇)为一个墩。乾隆年间，大的墩称为乡，有中岐乡、闽岐乡(今上岐、君竹)、园岐乡(今旺岐)。光绪三十二年(1906年)，设马江区，辖两个半里，其中马尾属永北里，设有4个“图”，共17个村；闽安等属江右里，设有1个“图”，共25个村；琅岐设区，称嘉屿区，共有1个“里”、7个“图”、11个村；亭江分两个“里”，即上合北里和下合北里。
    民国时期，民国2年(1913年)，马尾设镇，称马江镇。民国24年，设区，马尾地区为闽侯县第二区。民国28年，区署在闽安镇；民国31年属鼓山区，区署在魁岐乡。民国34年，亭江、闽安合设为镇，称闽亭镇；琅岐设乡，称嘉登乡。马江镇、闽亭镇、嘉登乡各设乡(镇)公所。直至1949年福州解放。
    1949年9月，马尾、亭江、琅岐归属闽侯县人民政府第三区公所；同年12月，析第三区嘉登(琅岐)乡为闽侯县人民政府第二区公所。1951年，马尾镇设镇人民政府，隶属第三区公所。1952年下半年，组建马尾特别区(又称闽江港口特别区)，甲等县建制，1953年6月撤销，复隶闽侯县第三区公所。1956年4月，马尾区与琅岐区合并，成立马尾区公所。1958年8月，马尾区公所撤销，成立马尾镇、亭江镇、琅岐镇；同年11月，马尾、亭江、琅岐镇均改为人民公社，设公社管理委员会。1960年1月，马尾从闽侯县划归福州市郊区。同年3月16日，马尾设县级区，成立马尾区人民委员会。1961年6月，撤销马尾区人民委员会，设立马尾行政办事处，履行福州市人民委员会派出机关职能；同年12月，马尾行政办事处撤销，复设马尾区人民委员会。1963年6月10日，马尾区人民委员会撤销，设立马尾区公所；亭江、琅岐也同时分别设立区公所，作为福州郊区行政办事处派出机构。1966年3月，琅岐区公所改为人民公社。1968年9～10月，马尾、亭江区公所和琅岐公社先后改为区革命委员会，与郊区关系不变。1969年11月，马尾、亭江、琅岐区革命委员会分别改为人民公社建制。1970年2月13日，琅岐划归连江县，马尾公社、亭江公社和渔业公社合组为马江公社革命委员会。同年5月1日，马尾再度设区，称马江区，马江公社革命委员会改为马江区革命委员会。1975年12月，琅岐从连江县划还福州市郊区。1978年2月24日，马尾划归福州市郊区，撤销马江区革命委员会，恢复马尾镇，并保留马尾人民公社。1982年8月26日，马尾置县级区，成立马尾区人民政府，从福州市郊区析出马尾镇和马尾公社，马尾镇改为街道办事处，城镇居民组建居民委员会。1984年4月，马尾、亭江、琅岐人民公社分别改为马尾乡、亭江乡、琅岐乡，设乡人民政府，乡以下设村民委员会、村民小组。1985年1月23日，经国务院批准，在马尾区内划出4.4平方公里辟为福州经济技术开发区(简称开发区)，设立开发区管理委员会，马尾区与开发区并存。1988年8月，亭江乡改为镇建制，设亭江镇人民政府。1991年10月，琅岐乡改为镇建制，设琅岐镇人民政府，1993年1月1日，马尾区与开发区“两区合一”实行两块牌子、一套行政机构。1994年3月21日，马尾乡改为镇建制，设马尾镇人民政府。1995年12月15日，马尾街道更名为罗星街道，仍设街道办事处。至1997年底，马尾区人民政府下辖马尾、亭江、琅岐三个镇政府以及罗星街道一个办事处。